Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm3239L7N2D9 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm3239L7N2D9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm3239L7N2D9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm3239L7N2D9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Gm3239L7N2D9 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3239L7N2D9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3239L7N2D9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3239L7N2D9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3239L7N2D9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3239L7N2D9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3239L7N2D9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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