Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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