Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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