Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms