Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms