Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms