Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms