Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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