Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms