Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm3238W4VSP7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm3238W4VSP7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm3238W4VSP7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm3238W4VSP7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm3238W4VSP7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3238W4VSP7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3238W4VSP7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3238W4VSP7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3238W4VSP7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms