Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cpne6Q9Z140 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms