Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggps1Q9WTN0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ggps1Q9WTN0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms