Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zeb2Q9R0G7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zeb2Q9R0G7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms