Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh11Q9QYF1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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Rdh11Q9QYF1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Rdh11Q9QYF1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Rdh11Q9QYF1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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