Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn4Q9QXZ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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Opn4Q9QXZ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn4Q9QXZ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms