Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limd1Q9QXD8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limd1Q9QXD8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms