Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpc5Q9QX29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpc5Q9QX29 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc5Q9QX29 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpc5Q9QX29 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms