Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mid2Q9QUS6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mid2Q9QUS6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mid2Q9QUS6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms