Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja4Q9JMC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnaja4Q9JMC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaja4Q9JMC3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaja4Q9JMC3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaja4Q9JMC3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms