Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem1Q9JKE2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms