Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad9Q9JIW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms