Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Praf2Q9JIG8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Praf2Q9JIG8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Praf2Q9JIG8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms