Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r3fQ9JIG4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp1r3fQ9JIG4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms