Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn12Q9ET43 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms