Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms