Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop5Q9DB28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop5Q9DB28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.8 ms