Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpap3Q9D706 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpap3Q9D706 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms