Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmed5Q9CXE7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms