Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd1Q9CQA6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms