Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trex1Q91XB0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trex1Q91XB0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms