Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3I3

Cog6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog6Q8R3I3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cog6Q8R3I3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cog6Q8R3I3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cog6Q8R3I3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cog6Q8R3I3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cog6Q8R3I3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cog6Q8R3I3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cog6Q8R3I3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cog6Q8R3I3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cog6Q8R3I3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cog6Q8R3I3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cog6Q8R3I3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms