Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup58Q8R332 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup58Q8R332 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup58Q8R332 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup58Q8R332 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup58Q8R332 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup58Q8R332 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms