Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ufl1Q8CCJ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms