Protein–RNA interactions for Protein: Q8CA72

Gan, Gigaxonin, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GanQ8CA72 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GanQ8CA72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GanQ8CA72 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GanQ8CA72 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms