Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccz1Q8C1Y8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccz1Q8C1Y8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccz1Q8C1Y8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms