Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sp8Q8BMJ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sp8Q8BMJ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sp8Q8BMJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp8Q8BMJ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms