Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHE5

Bmp3, Bone morphogenetic protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp3Q8BHE5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bmp3Q8BHE5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bmp3Q8BHE5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bmp3Q8BHE5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp3Q8BHE5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp3Q8BHE5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bmp3Q8BHE5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms