Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pknox2Q8BG99 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox2Q8BG99 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms