Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnpo1Q8BFY9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms