Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a20Q80UJ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc22a20Q80UJ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a20Q80UJ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms