Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnf1Q7TSH7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms