Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM1

Txlna, Alpha-taxilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnaQ6PAM1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TxlnaQ6PAM1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TxlnaQ6PAM1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TxlnaQ6PAM1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms