Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NesQ6P5H2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NesQ6P5H2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms