Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms