Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arhgap20Q6IFT4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms