Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2e1Q64104 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms