Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkciQ62074 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PrkciQ62074 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkciQ62074 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkciQ62074 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkciQ62074 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkciQ62074 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkciQ62074 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkciQ62074 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkciQ62074 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkciQ62074 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkciQ62074 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkciQ62074 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkciQ62074 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkciQ62074 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkciQ62074 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkciQ62074 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkciQ62074 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkciQ62074 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkciQ62074 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkciQ62074 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkciQ62074 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkciQ62074 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkciQ62074 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkciQ62074 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms