Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik5Q61626 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik5Q61626 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms