Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde3bQ61409 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde3bQ61409 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms