Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rabl6Q5U3K5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabl6Q5U3K5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms